Sàng lọc chất chủ vận thụ thể apelin dựa trên độ tương đồng phân tử và tối ưu hóa hiệu năng thông qua kỹ thuật voting-stacking

Tóm tắt

Đặt vấn đề: Apelin, một peptid mang hoạt tính sinh học, là phối tử nội sinh của thụ thể Apelin (APJ) liên kết protein G (APLNR) tìm thấy chủ yếu ở hệ thần kinh trung ương và các mô ngoại biên. Chức năng và tác dụng điều trị các bệnh mạn tính không lây nhiễm của APJ đã được công bố rất nhiều trong hai thập kỷ vừa qua. Nghiên cứu đánh giá khả năng ứng dụng của độ tương đồng phân tử trong sàng lọc ảo các chất chủ vận thụ thể APJ.

Mục tiêu: Sàng lọc các chất chủ vận thụ thể Apelin bằng cách ứng dụng độ tương đồng phân tử dựa trên các dấu vân tay phân tử, đồng thời tối ưu hóa hiệu năng sàng lọc thông qua các phương pháp học tập kết hợp Voting và Stacking.

Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Ba chất tham chiếu có hoạt tính chủ vận thụ thể Apelin mạnh (CMF-019, AMG-986, BMS-986224) được dùng để đánh giá khả năng nhận diện chất có hoạt tính dựa trên độ tương đồng phân tử thông qua tính toán 12 loại dấu vân tay và hệ số tương đồng Tanimoto. Phương pháp học tập kết hợp Voting và Stacking cũng được áp dụng nhằm cải thiện hiệu năng tổng thể. Khả năng sàng lọc chất chủ vận thụ thể Apelin dựa trên độ tương đồng được đánh giá dựa trên các chỉ số AUC, EF, GH và F1.

Kết quả: Phương pháp dựa trên độ tương đồng phân tử cho thấy hiệu năng sàng lọc cao; việc tích hợp phương pháp học tập kết hợp cải thiện hiệu năng sàng lọc hướng chủ vận thụ thể Apelin, với kết quả đánh giá ngoại AUC = 0,997; GH= 0,924 ; F1= 0,875

Từ khóa: Apelin/APJ; bệnh mạn tính không lây nhiễm; sàng lọc ảo; độ tương đồng phân tử; Voting; Stacking