Quy trình Duplex PCR phát hiện đồng thời Vibrio parahaemolyticus và White Spot Syndrome Virus (WSSV) gây bệnh trên tôm biển

Tóm tắt

Với việc tăng cường diện tích nuôi cùng với biến đổi khí hậu, ngành nuôi tôm hiện đang gặp nhiều trở ngại, đặc biệt là thiệt hại do mầm bệnh. Sự cần thiết phải phát hiện và sàng lọc các mầm bệnh là một trong những nhiệm vụ quan trọng nhất vì rất khó để kiểm soát khi nào dịch bùng phát. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm tối ưu hóa quy trình duplex PCR (dPCR) phát hiện đồng thời vi-rút gây bệnh đốm trắng (WSSV) và Vibrio parahaemolyticus, hai mầm bệnh gây thiệt hại lớn về mặt kinh tế cho ngành nuôi tôm biển. Mục tiêu chính của nghiên cứu này là chuẩn hóa giảm nồng độ mồi, dNTPs và MgCl₂ nhằm phát triển quy trình có độ nhạy và độ đặc hiệu cao và khả năng phát hiện thời gian ngắn. Kết quả cho thấy: (i) Phương pháp PCR được tối ưu hóa phát hiện đồng thời vi-rút gây bệnh đốm trắng (WSSV) và Vibrio parahaemolyticus (Vp_AHPND); (ii) Cụ thể của PCR tối ưu hóa là 100 pg/µL đối với WSSV và 10 ng/µl đối với V. parahaemolyticus; (iii) Xác định tính đặc hiệu và ứng dụng của PCR duplex để phát hiện đồng thời vi-rút gây bệnh đốm trắng (WSSV) và V. parahaemolyticus (Vp_AHPND) trên tôm biển.