Đánh giá đa dạng di truyền lan kiếm tiên vũ (Cymbidium finlaysonianum) dựa trên chỉ thị SSR
Từ khóa
Tóm tắt
Lan kiếm tiên vũ (Cymbidium finlaysonianum) là một trong những loài lan kiếm bản địa Việt Nam, đa dạng về hình thái và màu sắc, có giá trị cao nhưng đang bị suy kiệt nguồn gen do sự khai thác quá mức. Nghiên cứu này đánh giá đa dạng di truyền 32 mẫu lan kiếm tiên vũ dựa trên chỉ thị sinh học phân tử SSR nhằm phục vụ cho công tác bảo tồn và phát triển giống. Kết quả cho thấy 12 primer SSR hiển thị tính đa hình cao với tần số alen đa hình trung bình là 0,22; số lượng alen trung bình 3,5 alen/primer, dao động từ 2 - 6 alen/primer. Bên cạnh đó, sự đa dạng di truyền cao giữa các mẫu lan kiếm cũng được ghi nhận qua hệ số đa hình (Polymorphic information content, PIC) là 0,79; dao động từ 0,58 đến 0,94. Kết quả phân tích mối quan hệ di truyền cho thấy các mẫu lan kiếm thu thập có khoảng cách đa dạng di truyền dao động từ 0,02 - 0,4 với giá trị trung bình là 0,17 và cây phân nhóm di truyền chia thành 06 nhóm chính, nhóm I (Ia, Ib) gồm 18 mẫu, nhóm Ic (04 mẫu), IIa (07 mẫu), IIb (02 mẫu) và III gồm 01 mẫu. Dữ liệu di truyền dựa trên chỉ thị SSR này hữu ích cho công tác lai tạo giống mới và bảo tồn nguồn gen lan kiếm tiên vũ nói riêng cũng như các loài thuộc chi Cymbidium nói chung.
Lượt tải
Tài liệu tham khảo
Anuttato, S., Boonruangrod, R., Kongsamai, B., & Chanprame, S. (2017). Morphological characterization of wild Rhynchostylis gigantea in Thailand. Journal of International Society for Southeast Asian Agricultural Sciences 23(2), 20-32.
Chandra, D. L., Pathak, P., Rao, A. N., & Rajeevan, P. K. (Eds.). (2015). Commercial orchids. Berlin, Germany: De Gruyter Open.
Chung, Y. L., Kuo, Y. T., & Wu, W. L. (2017). Development of SSR markers in Phalaenopsis orchids, their characterization, crosstransferability and application for identification. Singapore: World Scientific.
Huang, J. L., Zeng, C. X., Li, H. T., & Yang, J. B. (2011). Isolation and characterization of 15 microsatellite markers from the spring orchid (Cymbidium goeringii) (Orchidaceae). American Journal of Botany 98(4), e76-e77. http//doi. org/10.3732/ajb.1000446.
Hyun, Y. S., Kim, J., & Chung, K. W. (2012). Development of polymorphic microsatellite markers for Cymbidium goeringii (Orchidaceae). American Journal of Botany 99(5), e193-e198. http//doi.org/10.3732/ajb.1100505.
Lee, H. J., Park, H. R., Lee, A. J., Nam, D. E., Lee, D. G., Do, Y., & Chung, K. W. (2020). Genetic authentication of cultivars with flowervariant types using SSR markers in spring orchid, Cymbidium goeringii. Horticulture, Environment, and Biotechnology 61(3), 577-590.
Li, X., Jin, F., Jin, L., Jackson, A., Huang, C., Li, K., & Shu, X. (2014). Development of Cymbidium ensifolium genic SSR markers and their utility in genetic diversity and population structure analysis in cymbidiums. BMC Genetics 15, 124. http//doi.org/10.1186/s12863-014-0124-5.
Moe, K. T., Zhao, W., Song, H. S., Kim, Y. H., Chung, J. W., Cho, Y. I., Park, P. H., Park, H. S., Chae, S. C., & Park, Y. J. (2010). Development of SSR markers to study diversity in the genus Cymbidium. Biochemical Systematics and Ecology 38(4), 585-594.
Nayak, N. R., Tanaka, M., Teixeira, D., & Silva, J. (Eds.). (2006). Biotechnology of Cymbidium - An overview of recent progress and future opportunities. Isleworth, UK: Global Science Books.
Silva, T. J. A., Jin, X., Dobránszki, J., Lu, J., Wang, H., Zotz, G., Cardoso, J. C., & Zeng, S. (2016). Advances in Dendrobium molecular research: Applications in genetic variation, identification and breeding. Molecular Phylogenetics and Evolution 95, 196-216. http//doi.org/10.1016/j.ympev.2015.10.012.
Tran, H. (Ed.). (2000). The orchids of Vietnam. Ho Chi Minh City, Vietnam: Agricultural Publishing House.
Xia, K., Ye, X., & Zhang, M. (2008). Isolation and characterization of nine microsatellite markers for Cymbidium sinense. HortScience 43(6), 1925-1926. https://doi.org/10.21273/HORTSCI.43.6.1925.
Yang, J. B., Tang, M., Li, H. T., Zhang, Z. R., & Li, D. Z. (2013). Complete chloroplast genome of the genus Cymbidium: lights into the species identification, phylogenetic implications and population genetic analyses. BMC Evolutionary Biology 13, 84. https://doi.org/10.1186/1471-2148-13-84.
Zhao, T. M., Zheng, S. G., Hu, Y. D., Zhao, R. X., Li, H. J., Zhang, X. Q., & Chun, Z. (2019). Classification of interspecific and intraspecific species by genome-wide SSR markers on Dendrobium. South African Journal of Botany 127, 136-146. https://doi.org/10.1016/j.sajb.2019.08.051.
