QUAN HỆ TIẾN HÓA CỦA CÁC DÒNG PHỤ OMICRON

Tóm tắt

Thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank, Hoa Kỳ được 21 trình tự protein gai S của các biến thể Omicron SARS-CoV-2 và một trình tự S tham chiếu (QIC53213) của biến thể Gốc. Kết quả sắp hàng nhiều trình tự S đã nhận diện được ba dòng phụ Omicron là BA.1 (B.1.1.529.1), BA.2 (B.1.1.529.2) và BA.3 (B.1.1.529.3). Cả ba dòng phụ BA.1, BA.2 và BA.3 đều có quan hệ tiến hóa xa với dòng Gốc với khoảng cách lần lượt là 0,02410, 0,02225 và 0,02559. Hai dòng phụ BA.1 và BA.3 có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với khoảng cách 0,00438. Đặc biệt, dòng phụ BA.2 có quan hệ tiến hóa xa với các dòng phụ BA.1 và BA.3 với khoảng cách tương ứng là 0,01285 và 0,01078